在香港注册有限公司，除了其具有的优点外，香港公司还有以下缺点：
1、公开数据 ── 法例规定公司必须向公司注册处呈报某些数据，向公众披露。例如，公司要将下列数据存盘方便公众查阅：资本结构；股东、董事及秘书的个人资料；抵押转让股份等。公众公司更要将周年帐目公开披露。
2、公司受《公司条例》规管。与合伙经营比较，成立公司的程序较为繁复。此外，在公司成立后，董事和秘书继续有责任向公司注册处呈报指定的报表。公司亦须备妥经审核的帐目。
3、程序复杂 ── 公司必须保存某些登记册，例如成员登记册、董事及秘书登记册、押记登记册等。在公司运作中也有各类会议，例如股东周年大会、特别股东大会、董事局会议等。公司必须保存这些会议的记录。决议也有多种。投资者有意成立公司必须对此有所掌握。
4、结束营业 ── 通常，公司结业只可以清盘。清盘时必须委托清盘人变卖公司的资产、将变卖所得分派给债权人和股东。如果公司的资产足以抵销负债，可由公司成员自动清盘结业。如果资产不足以抵销债务，正常的做法是由债权人自动清盘或强迫清盘。清盘的程序本身既复杂又昂贵，往往需要委聘律师或会计师事务所办理。一间「普通」的公司清盘费用可能超过1万元。
5、税务 ── 公司利得税税率是17.5%，稍高于独资企业和合伙商号。不过，公司很多开支都可以扣税，例如董事酬金，所以，虽然公司税率较高，但成立私人有限公司也未必一无是处。
